MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 plasmid pDRPIS7493

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015876	T	6	6	30	35	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015876	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015876	TGA	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015876	CA	3	6	118	123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015876	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015876	GAG	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015876	ATGA	2	8	225	232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015876	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015876	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015876	CAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015876	TTTG	2	8	428	435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015876	GTC	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015876	AGG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015876	GAT	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015876	GA	3	6	708	713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015876	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015876	TGG	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015876	TAGA	2	8	784	791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015876	GAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015876	GAC	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015876	TGT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015876	TCAA	2	8	934	941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015876	AAG	2	6	976	981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015876	AAG	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015876	AG	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015876	TTG	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015876	AAGC	2	8	1371	1378	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015876	AGG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015876	CTT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164904
30	NC_015876	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164904
31	NC_015876	AGT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164904
32	NC_015876	GT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015876	TAGC	2	8	1584	1591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015876	A	6	6	1594	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015876	TGA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015876	ACT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015876	TTG	3	9	1658	1666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015876	CGGT	2	8	1747	1754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015876	T	9	9	1894	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	342164905
40	NC_015876	A	9	9	1911	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	342164905
41	NC_015876	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	342164905
42	NC_015876	TACT	2	8	1951	1958	25 %	50 %	0 %	25 %	342164905
43	NC_015876	ACTT	2	8	1964	1971	25 %	50 %	0 %	25 %	342164905
44	NC_015876	TA	4	8	1972	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	342164905
45	NC_015876	TAT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164905
46	NC_015876	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164905
47	NC_015876	A	6	6	2035	2040	100 %	0 %	0 %	0 %	342164905
48	NC_015876	A	6	6	2057	2062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015876	A	6	6	2079	2084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015876	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015876	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015876	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015876	TA	3	6	2162	2167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015876	A	6	6	2180	2185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015876	A	6	6	2206	2211	100 %	0 %	0 %	0 %	342164906
56	NC_015876	TAG	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
57	NC_015876	AAAG	2	8	2353	2360	75 %	0 %	25 %	0 %	342164906
58	NC_015876	TGA	2	6	2525	2530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
59	NC_015876	AAATT	2	10	2546	2555	60 %	40 %	0 %	0 %	342164906
60	NC_015876	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
61	NC_015876	TGC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164906
62	NC_015876	TTC	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164906
63	NC_015876	TCAAA	3	15	2658	2672	60 %	20 %	0 %	20 %	342164906
64	NC_015876	ATT	2	6	2680	2685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164906
65	NC_015876	TGA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
66	NC_015876	AG	3	6	2781	2786	50 %	0 %	50 %	0 %	342164906
67	NC_015876	AGA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
68	NC_015876	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	342164906
69	NC_015876	CAAG	2	8	2958	2965	50 %	0 %	25 %	25 %	342164906
70	NC_015876	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
71	NC_015876	GACA	2	8	2981	2988	50 %	0 %	25 %	25 %	342164906
72	NC_015876	T	6	6	3000	3005	0 %	100 %	0 %	0 %	342164906
73	NC_015876	AGC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015876	TGA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015876	TCTT	2	8	3169	3176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015876	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
77	NC_015876	ACC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
78	NC_015876	ACT	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164907
79	NC_015876	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
80	NC_015876	CCA	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
81	NC_015876	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	342164907
82	NC_015876	CTC	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164907
83	NC_015876	ACC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
84	NC_015876	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
85	NC_015876	TGT	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164907
86	NC_015876	AGA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164907
87	NC_015876	TAAA	2	8	3623	3630	75 %	25 %	0 %	0 %	342164907
88	NC_015876	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	342164907
89	NC_015876	T	6	6	3660	3665	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
90	NC_015876	T	8	8	3722	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
91	NC_015876	ATT	2	6	3731	3736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
92	NC_015876	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
93	NC_015876	ATA	2	6	3812	3817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908
94	NC_015876	TAT	3	9	3822	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
95	NC_015876	TAG	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164908
96	NC_015876	TGT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164908
97	NC_015876	G	6	6	3921	3926	0 %	0 %	100 %	0 %	342164908
98	NC_015876	GTAT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	25 %	0 %	342164908
99	NC_015876	AAT	2	6	3976	3981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908
100	NC_015876	GAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015876	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015876	TG	3	6	4042	4047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015876	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015876	A	6	6	4149	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015876	A	6	6	4192	4197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015876	T	7	7	4218	4224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015876	CT	3	6	4258	4263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015876	AAGTA	2	10	4294	4303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015876	TTATA	2	10	4311	4320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015876	CTAG	2	8	4358	4365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015876	GAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015876	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015876	TG	3	6	4686	4691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015876	ATT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015876	T	7	7	4720	4726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.